农工华东交通大学支部于1988年10月22日成立，目前，农工党华东交通大学委员会共有党员21人。

2011年11月11日，农工华东交通大学支部召开换届选举大会，选举产生了杨辉为主任委员，陈世明、刘觉夫为副主任委员的新一届农工华东交通大学支部委员会。2024年10月9日，农工党华东交通大学支部召开党员大会进行届中调整，选举段戈宏同志为支部主委，曾伟同志为支部副主委，胡文韬、席岳峰同志为支部委员。